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分(fen)子蒸餾在來(lai)操(cao)(cao)作的過程中通常是選用其(qi)(qi)特殊的液(ye)態分(fen)離技術(shu)，其(qi)(qi)分(fen)子蒸餾技術(shu)的基本原理及(ji)其(qi)(qi)不同于一般蒸餾技術(shu)的特征，在來(lai)操(cao)(cao)作的過程中主要依(yi)靠不同物質分(fen)子運動平(ping)均自由程的差(cha)異完成分(fen)離。

分子(zi)蒸(zheng)餾在高(gao)真空下操控的蒸(zheng)餾方(fang)式，其蒸(zheng)氣分子(zi)的平均自由程(cheng)超過蒸(zheng)發表面(mian)與冷凝表面(mian)間(jian)的距離(li)，進而(er)可利用(yong)料液中各成分蒸(zheng)發速度的差別，對(dui)液態混(hun)合(he)物進行分離(li)。

分(fen)(fen)(fen)子蒸(zheng)餾必須在特(te)殊(shu)的(de)設計蒸(zheng)發器內才能達到，這樣可以在特(te)定真空環境(jing)下，這時候(hou)的(de)物(wu)(wu)料蒸(zheng)氣(qi)分(fen)(fen)(fen)子的(de)平均自(zi)由程超過蒸(zheng)發表面與冷凝表面間的(de)距離，進而(er)可利用料液(ye)(ye)中(zhong)各成分(fen)(fen)(fen)蒸(zheng)發速度的(de)差別，對液(ye)(ye)態混合(he)物(wu)(wu)進行分(fen)(fen)(fen)離，當液(ye)(ye)態混合(he)物(wu)(wu)沿發熱板流(liu)動且(qie)被加(jia)溫，輕、重分(fen)(fen)(fen)子會逸出(chu)液(ye)(ye)位而(er)進入液(ye)(ye)相。

分(fen)子(zi)蒸餾會因其輕(qing)、重(zhong)分(fen)子(zi)的權利程(cheng)不同(tong)(tong)，在來操(cao)作的過程(cheng)中其不同(tong)(tong)物質(zhi)分(fen)子(zi)從液位逸出后移動間距(ju)不同(tong)(tong)，若能合理地(di)設定(ding)一塊冷(leng)(leng)凝(ning)(ning)板，則輕(qing)分(fen)子(zi)達到冷(leng)(leng)凝(ning)(ning)板被冷(leng)(leng)凝(ning)(ning)排出，而(er)重(zhong)分(fen)子(zi)達不到冷(leng)(leng)凝(ning)(ning)板沿混合液排出。

分子(zi)(zi)蒸(zheng)餾中因(yin)其蒸(zheng)發(fa)分子(zi)(zi)遠勝于氣(qi)體(ti)分子(zi)(zi)，在一(yi)定程度上大(da)都具有相同(tong)的運動(dong)方向，所以它(ta)們本身撞擊對(dui)飛(fei)射目標和(he)蒸(zheng)發(fa)速率影(ying)響(xiang)不大(da)。殘氣(qi)分子(zi)(zi)在雙(shuang)面間呈雜亂無章的熱(re)運動(dong)狀態，故殘氣(qi)分子(zi)(zi)數目的多少(shao)是(shi)決定飛(fei)射目標和(he)蒸(zheng)發(fa)速率的重要因(yin)素。